无尘车间的主要目的就是控制空气污染，无尘车间必须将空气尘埃量降到更低甚至达到无尘效果，这就要求净化空调要配备好的过滤系统。 而且过滤器的性能好坏，也关系到对生产车间尘埃和微生物控制的效果。 所以净化空调空气过滤器的品质要求比较高，无尘室需要配备三级过滤，分别为空气处理机组配备的初级和中效过滤器，以及送风末端配置的高效过滤器。
2.净化空调系统温湿度精度高
普通空调的舒适性要求一般精度有限。但无尘车间的空调为了满足工艺要求，应对不同的温度和湿度差异要求，净化系统空调的温度和湿度的精度要求非常高。 必须保证无尘室内恒温恒湿。而且空调机组还需有制冷加热、加湿除湿这些功能，而且必须精密调控。
3.净化工程空调系统风大
无尘室最重要的功能是过滤空气中的细菌和尘埃，严格把控空气中粒子，净化空气质量使其到达洁净标准。 净化工程中空调系统首要特点是风量要足够大，这样才能保证无尘车间的洁净度。 空调风量的大小，主要是根据换气次数调定的。 一般来说单向流的无尘室，换气次数比较多。
4.严格控制正负压
所有的净化生产车间，都必须严格防止粉尘和细菌的扩散。 而为了防止病毒和细菌扩散，就必须控制好无尘室内的正负压。 一般无尘车间都是采用正压维持，负压控制。 负压可以有效对付有毒气体与易燃易爆物品和溶剂。 压差控制值的准确度，一般和漏风率的关系比较大，普遍的认识是比较低的漏风率比较容易控制度。
5.净化空调系统风机风压头要高
一般来说无尘车间空调系统都会使用不同等级的过滤器，主要分初级、中级和这三种。这三级过滤器阻力基本都是有 700-800 帕。因此无尘室一般会采用集中和回风这两种方式。为了严格把控无尘室内正负压的调节，无尘车间空调管道的阻力一般比较大。而要克服阻力因素，就必须让空气处理机组中的送风机压头要足够高。
6.采用变频技术
洁净空调系统大风量的特点带来了高能耗，各种节能技术在洁净空调系统中得到广泛的应用。 其中变频技术在洁净空调系统中被广泛的选用。 在无尘室中选用空气处理机组的送风机,电机功率都是按过滤器的终阻力来选型的，在空调系统运行初期，风机的压力是足够克服系统的阻力来满足使用要求的，这时候采用变频器，可以将风机的转速降低，减少功耗，起到良好的节能目的； 随着系统的运行，过滤器的阻力越来越大，空调系统的风量将会减少，通过风管里风量或者是静压变化提供变化的数据给变频器，又变频器将风机的转速变大，就可以满足系统风量的要求，同时也可以对风机转速的调节，对房间的正负压保持有良好的调节作用。 另外选用变频风机，也可以在无尘室不使用时，将机组的转速变低，送风机的风量减少，相当于值班风机的使用。
7.相当的稳定性和可靠性
现代工业的高速发展，使得工业产品拥有体积小、高价值的特点，如果洁净空调机出现故障，将带来数于万计的损失，特别是医用无尘室中，如果在手术或者是产房过程中，如果空调机组出现故障，将带来生命的安危，因此要求组合式空调机组拥有相当的稳定性和可靠性，要求空气处理机组的每一个部件采购中应该采用拥有良好的品质管理的厂家的产品，如在机组内部应该选用有认证的高品质风机和高品质的电机，对过滤器的选用也要非常慎用，特别是高效过滤器，如果有一个小孔，就带来无数的细菌，后果是无法想象的。 另外在空气处理机组的生产和检测也要严格按照的标准制造。

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